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引物退火溫度會影響到熒光-PCR法?

更新時間:2021-11-10點擊次數:775
   定量熒光-PCR法是在PCR定性技術基礎上發展起來的定量技術。實時熒光定量PCR技術(FQ-PCR)是一種在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法,實現了PCR從定性到定量的飛躍。
  簡單的說,就是在PCR體系中加入熒光,以便對反應體系和反應進程進行監測、記錄、分析。而熒光PCR儀是在普通PCR的基礎上加上個熒光探頭和相應的數據處理軟件。
  說道引物的一個重要參數是熔解溫度(Tm),這是當50%的引物和互補序列表現為雙鏈DNA分子時的溫度。Tm對于設定PCR退火溫度是必需的。在理想狀態下,退火溫度足夠低,以保證引物同目的序列有效退火,同時還要足夠高,以減少非特異性結合。合理的退火溫度從55-70℃。退火溫度一般設定比引物的Tm低5℃。
  設定Tm有幾種公式。確定引物Tm最可信的方法是近鄰分析法。大部分計算機程序使用近鄰分析法。從序列一級結構和相鄰堿基的特性預測引物的雜交穩定性。所有軟件會自動計算引物的Tm值,在設置退火溫度時可如下進行:
  以低于估算的Tm5℃作為起始的退火溫度,以2℃為增量,逐步提高退火溫度。較高的退火溫度會減少引物二聚體和非特異性產物的形成。為獲得理想結果,兩個引物應具有近似的Tm值。引物對的Tm差異如果超過5℃,就會由于在循環中使用較低的退火溫度而表現出明顯的錯誤起始。如果兩個引物Tm不同,將退火溫度設定為比低的Tm低5℃?;蛘邽榱颂岣咛禺愋?,可以在根據較高Tm設計的退火溫度先進行5個循環,然后再根據較低Tm設計的退火溫度進行剩余的循環。這使得在較為嚴謹的條件下可以獲得目的模板的部分拷貝。

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