近年來，
熒光-PCR法技術有了重大改進。將傳統PCR檢測模式中的PCR擴增和檢測相結合（即在同一個密閉容器中將PCR擴增反應與熒光標記探針檢測結合在一起）檢測目的核酸的檢驗方法紛紛出臺。這樣的檢測方法稱為“實時”PCR，表示PCR擴增產物可被實時檢測。準確地說，“實時”是指在每一個PCR循環后檢測擴增產物，當PCR擴增反應結束后，我們可得到每個樣品的PCR擴增產物變化曲線。通過分析這些反應曲線，不但可得到病原體的定性檢測結果，還可對病原體的數量進行精確定量。
實時熒光-PCR法不僅具有普通PCR的高靈敏性，而且由于應用了熒光探針，可通過光電傳導系統直接探測PCR擴增過程中熒光信號的變化以獲得定量結果，所以還具有DNA雜交的高特異性和光譜技術的高準確性，克服了常規PCR的許多缺點。
熒光-PCR法相比較普通PCR模式的優勢：
1.由于實時熒光PCR采用封閉的檢測模式，因此擴增產物導致污染的可能性比普通PCR要小得多。
2.由于擴增產物的檢測在PCR擴增過程中同時進行，并且數據的采集、分析全部由儀器自動完成，因此整個檢測所需的時間比普通PCR要節省許多。
3.實時熒光PCR檢測模式功能強大，具備定性、定量、突變、多項目等檢測功能。而普通PCR要完成上述項目需采用不同的技術平臺。
4.實時熒光PCR進行定量檢測時，其定量線性范圍（5-6 logs）比普通PCR（2-3 logs）要寬得多。
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